build: updated support for building with MacPorts

Updated Macports support based on Homebrew support.  Set correct paths
for MacPorts-provided avr-gcc and libelf.

gdb: support sleep interval of 1s or greater

Split sleep interval into seconds and microseconds to create a valid
timeval to pass as the timeout to select().

Removed comment, which refers to old code that used a fixed interval.

Merge pull request #145 from xqms/interrupt_fifo_fix

sim_interrupts: fix FIFO move operation

sim_interrupts: fix FIFO move operation

The variable 'mini' is a FIFO index, not a direct index into the buffer!
Add the current read pointer to fix the operation.

Fixes a regression introduced in 599733f261f94317489c2cc8751fb84fd604e6fa.

Merge pull request #141 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16-fixup

core: fixup missing dependancy from r16 commit

core: fixup missing dependancy from r16 commit

several commits were pushed to a branch which I later split...
one commit had a dependency I missed which this fixes.

modified:   sim/sim_core.c
fix missing dependance in MOVW instruction.

Merge pull request #135 from bsekisser/bsekisser-master-timer-clear-cancel-changes

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

Merge pull request #134 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16

core: add pair of 16 bit set register functions

timer: rework timer clear commit.

reworked to use single function with const flag to clear.
set to inline, depends on dce.

modified:   sim/avr_timer.c

Merge pull request #133 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-flash16

core: change 16 bit flash access

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

modified:   sim/avr_timer.c
added: avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers
fixes a few oversights in original commit(s)

core: add pair of 16 bit set register functions

added: _avr_set_r16le and _avr_set_r16le_hl
_avr_set_r16le_hl preserves reverse register set order where used
two register set calls become a single call.

core: change 16 bit flash access

modified:   sim/sim_core.c
added _avr_flash_read16le accessor function
changed "avr->flash[addr] | (avr->flash[addr + 1] << 8)"
to "_avr_flash_read16le(avr, addr)"

ioport: Don't crash if core defition is incomplete

This is not something that happends on existing cores, but can be
annoying when defining a new one.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

io: No functional changes

Just reformating

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timer: Added a selective trace option

Allows tracing one timer only

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidio: Simplified pin mapping

Again...

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timers: Gratuitous realignment

Go on with the new, improved narrow codestyle

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ADC: Skip SRB register if not present

the mega8/16/32 don't have ADCSRB, this lead to a crash when we tried to
register a callback on it.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Mega 8/16/32 and PORTA

Still register portA, regardless of PORTA constant initialisation

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Gratuitous realignment

ODC got the better of me

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Converted to use the standard fifo

There's already a standard way to make FIFO's, so converted the
interrupt code to use that.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added support for mega324a / pa..

Support for the renamed SPI block, somehow my headers (debian) don't
have any definition of a second one, but, the macro /should/ support it
now.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #130 from TheCrazyT/twi_i2c_write_fix

Twi i2cwrite fix

fix for wrong return value of i2c_write.

Merge pull request #1 from dougszumski/twi_delay_fix

twi: Remove start condition delay

Merge pull request #126 from ddaygold/typo

Fixed a typo in the manual

Fixed a typo in the manual

Merge pull request #124 from frej/enable-adc-for-atiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

gdb: Cleanup

Also make sure we mask of only 24 bits of the address, newer gdb use one
somehow..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added TIMER2_COMPB to m2560

This was commented out, dunno why..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ihex: Streamlined implementation

Use ihex_read_chunk to implement ihex_read_file, and add a
ihex_free_chuncks for consistency sake

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Add a 'reset pc' that can be nonzero

This allows the AVR to soft reset into the bootloader for example.

A watchdog reset will re-run the bootloader with the correct flag.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

watchdog: Some cleanup

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

hex: Supports offsets larger then 64/128KB

New segemnt type for loading atmega2560 bootloaders

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

simduino: Simplified, made compatible with m2560

Allow testing on atmega256 bootloader too.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Renamed special_* core fields

Added a 'custom' sub struct

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Whitespaces at end of line removed..

Dunno how these came to be..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

elf: Detect start address (for bootloaders)

Allows loading a bootloader ELF as well as .hex with the right starting
PC

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Prevent crash when close() is called twice

flahs() wasn't checking for a valid file pointer

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Redone the logic of delivery

Simplified a few expressions

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Now track pending and running states

Introduced two new IRQs  per vector; one to track pending, and one to
track running state. So you can see any latency issues.
Also introduced a global pending/running IRQ, so you can track issues if
your interrupts overrun etc.

It is reasonably transparent, and seems to have had little impact on the
rest of the code... Hooray for nice clean APIs!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Increased limits

Turns out it's easy to reach 32 if you try hard enough!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

twi: Revert to NO_STATE after a stop

Otherwise the interrupt might get re-triggered

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

adc: Removed spurious trace

Accidentally commited this earlier

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidiot: Further pinout tweaks for 256's

Endless tweaks

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

twi: Always release STOP bit

Seems some libraries assume this bit will autoclear, even if
the stop condition was not really called for.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

adc: bit of reformating

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

shared: Some more tweaks to arduidiot_pins

Added remaining 2560 pins

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Small reformat of long lines

New screen format..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

simavr: Fixed mega250 pinouts for arduidiots

Referenced their headers

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

uart_pty: Added a flush timer

Makes sure the FIFO gets a chance to be cleared after a XOFF

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidiot_pins: Added mega2560

And added a few utilitarian macros.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #121 from guyzmo/improved_osx_support

added support for MacOSX homebrew

added support for MacOSX homebrew

Signed-off-by: Bernard `Guyzmo` Pratz <guyzmo+github@m0g.net>

Merge pull request #120 from frej/avoid-buffer-overrun

Avoid buffer overrun on smaller AVRs

Avoid buffer overrun on smaller AVRs

On smaller AVRs, such as the attiny13, MAX_IOs will be larger than the
size of SRAM which will lead to out of range writes to a malloc
allocated buffer. Therefore limit the number of bytes cleared to the
size of SRAM.

Merge pull request #119 from bsekisser/bsekisser-adc-initfix

adc: check r_adcsrb is valid before init

adc: check r_adcsrb is valid before init

fix issue #118

modified:   simavr/sim/avr_adc.c

Merge pull request #117 from bsekisser/bsekisser-flash-writefix

flash: be sure to use current page for writing

flash: be sure to use current page for writing

bound z to ~(page size - 1), otherwise write may start at anywhere in page to write and fail.

also corrected log line to previous state as was missleading/inacurate.

modified:   simavr/sim/avr_flash.c

lin: Don't reset regs at init time

the reset handler does it

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

lin: Checked a divide by zero condition

As it turn out, static analizer doesn't know lbt is >= 8. Added a
comment there all same for anyon else reading this.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ioport: Don't deref NULL on bad param

that ioctl requires a parameter, but doesn't check it. Static analyzer
doesn't like that at all.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #96 from bsekisser/bsekisser-master-core-remove-bclr-bset

core: Removal of duplicate code...

Merge pull request #110 from cskarai/fix-optiboot-watchdog

Optiboot bootloader unintentionally enables watchdog

Merge pull request #114 from xqms/atmega2560_uart3

Support IO register addresses >= 256

sim_avr.h: increase MAX_IOs by one to 280

ATmega2560 has UDR0 at 0x136 = 310

sim_core + sim_regbit: use 16 bit integers for IO addresses

This is necessary on the larger ATmegas (e.g. ATmega2560).

sim_core: don't hardcode max io register address, use MAX_IOs

add unit test for UART3 echo on ATmega2560

This fails currently because IO addresses >= 256 are not handled correctly
in the core.

Merge pull request #112 from cskarai/fix-timer-ocra-top

Reconfigure fast pwm timer at OCRA write  if OCRA is the top

Merge pull request #111 from cskarai/fix-adc-adate

Implemented: ADC free running mode

Reconfigure fast pwm timer at OCRA write  if OCRA is the top

Fixed: issue with indentation

Added: free_running autotrigger mode

Added: ADC trigger sources

Fixed: optiboot issue, watchdog is unintentionally enabled

Merge pull request #101 from dougszumski/mx_core_add_extint

cores: Adds missing external interrupt for m16/m32

Merge pull request #103 from distributed/dispatch

sim_io: do not overwrite _avr_io_mux_write in avr_register_io_write

do not overwrite _avr_io_mux_write in avr_register_io_write

Merge pull request #98 from bsekisser/bsekisser-watchdog-software-reset

watchdog: reworked to add support for software reset.

watchdog: reworked to add support for software reset.

support for software reset due to watchdog timeout...
based on watchdog documentation.

modified:   sim/sim_avr.c
modifications to avr_reset and avr_init to support software
reset.

modified:   sim/sim_avr.h
added type avr_run_t...
avr_t.run updated accordingly.

modified:   sim/avr_watchdog.c
largely rewritten to support software reset.

modified:   sim/avr_watchdog.h
data record 'reset_context' added to support software reset

modified:   sim/sim_regbit.h
added: avr_regbit_from_value
for checking flags before commiting register value.
added: avr_regbit_set_array_from_value
reverse operation of avr_regbit_get_array

Merge pull request #95 from bsekisser/master-core-run-many-limited-interrupt-state

interrupts: modify handling of interrupt state

twi: Remove start condition delay

  > This corrects a problem where a non-interrupt driven twi driver
    functions on the target (m32) but not in simavr.
  > This also fixes ../examples/board_i2ctest so that it functions as
    expected.

cores: Adds missing external interrupt for m16/m32

 > Async external interrupt (INT2) was missing on m16/32. Since unlike the others
   this interrupt uses only 1 bit for sense control avr_extint.* were modified to
   support this new mode.

interrupts: modify handling of interrupt state

Interrupt state edge detection and wait states combined into multi
function variable, enabling the removal of edge detection
code in the run loop and simplifying need to service interrupts
by placing the burden on code directly influencing the interrupt
handling state.

modified:   simavr/sim/sim_avr.c
edge detection code removed from both run loops.
raw (non-gdb) loop does precheck of interrupt state, while not
necessary, potentially saving a few cycles.

modified:   simavr/sim/sim_avr.h
uint8_t i_shadow changed to int8_t interrupt_state.

modified:   simavr/sim/sim_core.c
flag changes which may impact interrupt state are routed
through avr_sreg_set().
multi-cycle loop simplified to check avr->interrupt_state.

modified:   simavr/sim/sim_core.h
static inline avr_sreg_set() - handles changes to global
interrupt state and ensures wait states if I
flag changes from 0 -> 1.  superfluous 1 -> 1
states are ignored, should they occur. and
disabling interrupts clears avr->interrupt_state.
flag changes from SET_SREG_FROM routed to avr_sreg_set();

modified:   simavr/sim/sim_interrupts.c
avr_interrupt_reset()
interrupt_state cleared during reset.
avr_raise_intrrupt()
check interrupts enabled and no pending
interrupt_state before marking pending interrupt state.
avr_service_interrupts()
servicing code changed to tick pending wait state then
mark for any pending interrupts or set to zero
if none waiting.
on interrupt, direct interrupt state change to
avr_sreg_set();

modified:   simavr/sim/sim_interrupts.h
remove pending_wait.

modified:   tests/tests.c
interrupt edge dectection code removed from test run loop.
no further modifications required.

modified:   simavr/sim/sim_avr.c
modified:   simavr/sim/sim_avr.h
modified:   simavr/sim/sim_core.c
modified:   simavr/sim/sim_core.h
modified:   simavr/sim/sim_interrupts.c
modified:   simavr/sim/sim_interrupts.h
modified:   tests/tests.c

Merge pull request #100 from bsekisser/bsekisser-cores-spi-declare

cores: add spi declaration

Merge pull request #99 from bsekisser/bsekisser-cores-ioport-declare

cores: AVR_IOPORT_DECLARE

cores: add spi declaration

convert spi structure definitions to AVR_SPI_DECLARE

modified:   simavr/cores/sim_90usb162.c
modified:   simavr/cores/sim_mega128.c
modified:   simavr/cores/sim_mega1280.c
modified:   simavr/cores/sim_mega1281.c
modified:   simavr/cores/sim_mega128rfr2.c
modified:   simavr/cores/sim_mega169.c
modified:   simavr/cores/sim_mega2560.c
modified:   simavr/cores/sim_megax.h
modified:   simavr/cores/sim_megax4.h
modified:   simavr/cores/sim_megax8.h
modified:   simavr/cores/sim_megaxm1.h
modified:   simavr/sim/avr_spi.h

cores: AVR_IOPORT_DECLARE

convert port sructure declarations to macro AVR_IOPORT_DECLARE.

modified:   simavr/cores/sim_90usb162.c
modified:   simavr/cores/sim_mega128.c
modified:   simavr/cores/sim_mega1280.c
modified:   simavr/cores/sim_mega1281.c
modified:   simavr/cores/sim_mega128rfa1.c
modified:   simavr/cores/sim_mega128rfr2.c
modified:   simavr/cores/sim_mega169.c
modified:   simavr/cores/sim_mega2560.c
modified:   simavr/cores/sim_megax.h
modified:   simavr/cores/sim_tiny2313.c
modified:   simavr/sim/avr_ioport.h

core: Removal of duplicate code...

core contains two functionally equivalent blocks of code...  implimenting
cl?, se? and bclr, bset.   During operation the case code for
bclr and bset never get called, but as stated does not matter since
code at the top of the block performs the EXACT same function.
technically... using the case code SHOULD be the better performing
option...  at the moment though, neither one seems to exhibiting
any advantage over the other.

modified:   simavr/sim/sim_core.c

tests: Fix makefile

Was using ${OBJ} before it was declared.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

build: fix build of libsimavr.so

Was being linked with itself. Newer gcc are not amused.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

build: re-accelerated the build

Simavr used to build pretty quick, and it's been crawling for a while
now, turns out some of the enhancements we added to the SIMAVR path
detection were being evaluated a LOT.
So went to the makefile and made sure most of the static variables are
evaluated once only.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #94 from hedrok/master

Timer simulation fixes and improvements

Merge pull request #92 from cyrozap/master

Fix the issue where Intel HEX files with hex strings longer than 32 bytes would be truncated

Merge pull request #83 from bsekisser/master-core-run-many-limited

Changes to allow for free run in core between cycle timers

Merge pull request #82 from dougszumski/i2c_test_extension

examples: Extends i2ctest to include a second TWI driver