Workaround for UART issues when polling in some cases

Clear interrupt instead of just the rxc bit

misc: Spacing cleanup

Trailing space removal

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

elf: Fix elf_copy_section

How this ever worked is a wonder

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Add RAMPZ for the 1284p core

That was missing, fixes Issue #186

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

misc: Some more spacing issues

geany catches stray spaces

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #173 from hovercraft-github/timers-ext-clock

Add external clock pin definition and external clocking for timers.

Timers: fixes #177 (interrupt flags reset failure)

Timers: fixes #178, add timer external clock pin definition for megax cores.

Timers: added support for external clock input via a pin (Tn, TOSC1),

a variable frequency for virtual external clock sources including as2 asynchronous clock,
IO control for selecting external clock source and frequency,
external clock pin definition for most cores.

core: Fix rjmp/rcall wrapping around flash boundaries

As per PR #127, spliced

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

regbits: Added attribute unused

As per pull request #127

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

misc: Spacing issues fixed

Trailing spaces removed

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: fix for 1284p timer block

This is the 'approved' way to deal with optional peripherals. Check the
name, or check a register 'address' value for != 0 instead of trying to
use #ifdefs

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #181 from messani/master

Timer fix

casting to uint64_t instead of float

renamed variable cs_div_clock to cs_div_value

Merge pull request #180 from hovercraft-github/sim_gdb_fix

sim_gdb: fix for restore callbacks issue

sim_gdb: fix for restore callbacks issue

Merge pull request #172 from Lotharyx/master

Improve usage message by not listing cores by default

Changed "-list-cores" and "-help" to "--list-cores" and "--help" respectively
Formatted the usage statement to include variants (e.g. -gdb, -g; -trace, -t)

mmcu: add helper macro for sending multi-byte commands

Add helper macro SEND_SIMAVR_CMD() for sending multi-byte commands
in one line. The macro makes use of involved preprocessor trickery to
achieve recursion.

cmds: rewrite command handling and move to separate file

Move AVR command handling code to separate file and add support for
multi-byte, as well as user-defined, commands.

(cherry picked from commit c627c3720a6dcb1f8f7a3068510f11e3fbee0ce4)

Merge pull request #165 from inio/trace_port

Provide IRQs on PORT register when updated via PIN

elf: check for error instead of crashing

Check for error when allocating memory instead of dereferencing a NULL
pointer later in the program.

(cherry picked from commit b3ecaf43cba921c6a257132093107771074ab749)

Conflicts:
simavr/sim/sim_elf.c

elf: Clean up code duplication and fix a cast

Use the helper function elf_copy_section() to get rid of some code
duplication and use the correct printf() type so that there is no cast
necessary.

Conflicts:
simavr/sim/sim_elf.c

elf: Wire up support for Fuses and Lock Bits

Support reading fuses and lock bits from ELF files and loading them into
the simavr internals for later use.

cores: Add a field for Lock Bits and Boot Lock Bits

Add an extra byte for allowing simavr store the chip's lock bits / boot
lock bits as well as set the default value as defined in a number of
specs.

cores: Fix fuse support to handle proper byte size

avr-libc specifies platforms with only 6, 3, 2, 1, and 0 bytes of fuses.
Previously simavr only had 4 bytes available for fuses and assumed any
platform using the CORE_DECLARE macro would have 3 fuses. This change
allows the CORE_DECLARE macro to support any of the platforms supported
by avr-libc with regard to fuses. Additionally add some defines to make
it clear for users of simavr what order the fuses are in.

Merge pull request #176 from hovercraft-github/ext_int_level_triggering

Triggering by level for external interrupts

Merge pull request #161 from obra/patch-1

Small but crucial fix to Homebrew install instructions

Merge pull request #155 from neosilky/fix-memleak

Fix a small memory leak when returning after an error

Implement triggering by level for external interrupts. Fixes bug with Sense Control Bits number detection.

Embettered the usage statement; changed "--list-cores" to "-list-cores" to match "-help"

Removed core list from default usage message; added "--list-cores" command-line flag to list cores

timer: fix calculation of comp_cycles

- bsekisser was right, there must be ocr+1

timer: fixed calculation of divider when using asynchronous 32kHz timer

timer: fixed overflow and output capture interrupts

Provide IRQs on PORT register when updated via PIN

Fixes issue #164

Merge pull request #128 from Zirias/threadsafe-console

make console output thread-safe (q&d)

make console output thread-safe

Merge pull request #154 from squell/master

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 110…

Small but crucial fix to Homebrew install instructions

Merge pull request #158 from dougszumski/feature/ds1338_real_time_clock_part

Feature/ds1338 real time clock part

examples: TWI driver used by the DS1338 RTC demo

examples: take the DS1338 virtual real time clock for a test drive

This demo consists of a DS1338 RTC connected via the TWI bus of an
atmega32. The square wave output of the DS1338 is enabled, with the
tick-rate set to 1HZ. This is then fed to pin D3 on the atmega32
which is configured to generate an interrupt on a rising edge. When
the interrupt fires the time is read from the DS1338.

parts: DS1338 real time clock which runs on the TWI bus

Features:

> External oscillator synced to the AVR core
> Square wave output with scalable frequency
> Leap year correction until 2100 (just like the real thing!)

Should also work for the pin compatible DS1307 device, but that part
hasn't been tested against actual hardware.

Fix a small memory leak when returning after an error

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 1101 1000)

Merge pull request #148 from jedahan/install-instructions

Add install instructions

Merge pull request #149 from jedahan/homebrew-prefix

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Merge pull request #152 from stevedrake/macports-support

Update support for building with MacPorts

Merge pull request #153 from stevedrake/fix-sleep-1s

Support sleep interval of 1s or greater in gdb

build: updated support for building with MacPorts

Updated Macports support based on Homebrew support.  Set correct paths
for MacPorts-provided avr-gcc and libelf.

gdb: support sleep interval of 1s or greater

Split sleep interval into seconds and microseconds to create a valid
timeval to pass as the timeout to select().

Removed comment, which refers to old code that used a fixed interval.

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Add install instructions

Merge pull request #145 from xqms/interrupt_fifo_fix

sim_interrupts: fix FIFO move operation

sim_interrupts: fix FIFO move operation

The variable 'mini' is a FIFO index, not a direct index into the buffer!
Add the current read pointer to fix the operation.

Fixes a regression introduced in 599733f261f94317489c2cc8751fb84fd604e6fa.

Merge pull request #141 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16-fixup

core: fixup missing dependancy from r16 commit

core: fixup missing dependancy from r16 commit

several commits were pushed to a branch which I later split...
one commit had a dependency I missed which this fixes.

modified:   sim/sim_core.c
fix missing dependance in MOVW instruction.

Merge pull request #135 from bsekisser/bsekisser-master-timer-clear-cancel-changes

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

Merge pull request #134 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16

core: add pair of 16 bit set register functions

timer: rework timer clear commit.

reworked to use single function with const flag to clear.
set to inline, depends on dce.

modified:   sim/avr_timer.c

Merge pull request #133 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-flash16

core: change 16 bit flash access

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

modified:   sim/avr_timer.c
added: avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers
fixes a few oversights in original commit(s)

core: add pair of 16 bit set register functions

added: _avr_set_r16le and _avr_set_r16le_hl
_avr_set_r16le_hl preserves reverse register set order where used
two register set calls become a single call.

core: change 16 bit flash access

modified:   sim/sim_core.c
added _avr_flash_read16le accessor function
changed "avr->flash[addr] | (avr->flash[addr + 1] << 8)"
to "_avr_flash_read16le(avr, addr)"

ioport: Don't crash if core defition is incomplete

This is not something that happends on existing cores, but can be
annoying when defining a new one.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

io: No functional changes

Just reformating

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timer: Added a selective trace option

Allows tracing one timer only

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidio: Simplified pin mapping

Again...

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timers: Gratuitous realignment

Go on with the new, improved narrow codestyle

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ADC: Skip SRB register if not present

the mega8/16/32 don't have ADCSRB, this lead to a crash when we tried to
register a callback on it.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Mega 8/16/32 and PORTA

Still register portA, regardless of PORTA constant initialisation

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Gratuitous realignment

ODC got the better of me

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Converted to use the standard fifo

There's already a standard way to make FIFO's, so converted the
interrupt code to use that.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added support for mega324a / pa..

Support for the renamed SPI block, somehow my headers (debian) don't
have any definition of a second one, but, the macro /should/ support it
now.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #130 from TheCrazyT/twi_i2c_write_fix

Twi i2cwrite fix

fix for wrong return value of i2c_write.

Merge pull request #1 from dougszumski/twi_delay_fix

twi: Remove start condition delay

Merge pull request #126 from ddaygold/typo

Fixed a typo in the manual

Fixed a typo in the manual

Merge pull request #124 from frej/enable-adc-for-atiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

gdb: Cleanup

Also make sure we mask of only 24 bits of the address, newer gdb use one
somehow..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added TIMER2_COMPB to m2560

This was commented out, dunno why..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ihex: Streamlined implementation

Use ihex_read_chunk to implement ihex_read_file, and add a
ihex_free_chuncks for consistency sake

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Add a 'reset pc' that can be nonzero

This allows the AVR to soft reset into the bootloader for example.

A watchdog reset will re-run the bootloader with the correct flag.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

watchdog: Some cleanup

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

hex: Supports offsets larger then 64/128KB

New segemnt type for loading atmega2560 bootloaders

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

simduino: Simplified, made compatible with m2560

Allow testing on atmega256 bootloader too.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Renamed special_* core fields

Added a 'custom' sub struct

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Whitespaces at end of line removed..

Dunno how these came to be..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

elf: Detect start address (for bootloaders)

Allows loading a bootloader ELF as well as .hex with the right starting
PC

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Prevent crash when close() is called twice

flahs() wasn't checking for a valid file pointer

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Redone the logic of delivery

Simplified a few expressions

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Now track pending and running states

Introduced two new IRQs  per vector; one to track pending, and one to
track running state. So you can see any latency issues.
Also introduced a global pending/running IRQ, so you can track issues if
your interrupts overrun etc.

It is reasonably transparent, and seems to have had little impact on the
rest of the code... Hooray for nice clean APIs!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Increased limits

Turns out it's easy to reach 32 if you try hard enough!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

twi: Revert to NO_STATE after a stop

Otherwise the interrupt might get re-triggered

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

adc: Removed spurious trace

Accidentally commited this earlier

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>