timer: fixed calculation of divider when using asynchronous 32kHz timer

timer: fixed overflow and output capture interrupts

Merge pull request #128 from Zirias/threadsafe-console

make console output thread-safe (q&d)

make console output thread-safe

Merge pull request #154 from squell/master

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 110…

Merge pull request #158 from dougszumski/feature/ds1338_real_time_clock_part

Feature/ds1338 real time clock part

examples: TWI driver used by the DS1338 RTC demo

examples: take the DS1338 virtual real time clock for a test drive

This demo consists of a DS1338 RTC connected via the TWI bus of an
atmega32. The square wave output of the DS1338 is enabled, with the
tick-rate set to 1HZ. This is then fed to pin D3 on the atmega32
which is configured to generate an interrupt on a rising edge. When
the interrupt fires the time is read from the DS1338.

parts: DS1338 real time clock which runs on the TWI bus

Features:

> External oscillator synced to the AVR core
> Square wave output with scalable frequency
> Leap year correction until 2100 (just like the real thing!)

Should also work for the pin compatible DS1307 device, but that part
hasn't been tested against actual hardware.

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 1101 1000)

Merge pull request #148 from jedahan/install-instructions

Add install instructions

Merge pull request #149 from jedahan/homebrew-prefix

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Merge pull request #152 from stevedrake/macports-support

Update support for building with MacPorts

Merge pull request #153 from stevedrake/fix-sleep-1s

Support sleep interval of 1s or greater in gdb

build: updated support for building with MacPorts

Updated Macports support based on Homebrew support.  Set correct paths
for MacPorts-provided avr-gcc and libelf.

gdb: support sleep interval of 1s or greater

Split sleep interval into seconds and microseconds to create a valid
timeval to pass as the timeout to select().

Removed comment, which refers to old code that used a fixed interval.

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Add install instructions

Merge pull request #145 from xqms/interrupt_fifo_fix

sim_interrupts: fix FIFO move operation

sim_interrupts: fix FIFO move operation

The variable 'mini' is a FIFO index, not a direct index into the buffer!
Add the current read pointer to fix the operation.

Fixes a regression introduced in 599733f261f94317489c2cc8751fb84fd604e6fa.

Merge pull request #141 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16-fixup

core: fixup missing dependancy from r16 commit

core: fixup missing dependancy from r16 commit

several commits were pushed to a branch which I later split...
one commit had a dependency I missed which this fixes.

modified:   sim/sim_core.c
fix missing dependance in MOVW instruction.

Merge pull request #135 from bsekisser/bsekisser-master-timer-clear-cancel-changes

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

Merge pull request #134 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16

core: add pair of 16 bit set register functions

timer: rework timer clear commit.

reworked to use single function with const flag to clear.
set to inline, depends on dce.

modified:   sim/avr_timer.c

Merge pull request #133 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-flash16

core: change 16 bit flash access

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

modified:   sim/avr_timer.c
added: avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers
fixes a few oversights in original commit(s)

core: add pair of 16 bit set register functions

added: _avr_set_r16le and _avr_set_r16le_hl
_avr_set_r16le_hl preserves reverse register set order where used
two register set calls become a single call.

core: change 16 bit flash access

modified:   sim/sim_core.c
added _avr_flash_read16le accessor function
changed "avr->flash[addr] | (avr->flash[addr + 1] << 8)"
to "_avr_flash_read16le(avr, addr)"

ioport: Don't crash if core defition is incomplete

This is not something that happends on existing cores, but can be
annoying when defining a new one.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

io: No functional changes

Just reformating

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timer: Added a selective trace option

Allows tracing one timer only

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidio: Simplified pin mapping

Again...

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timers: Gratuitous realignment

Go on with the new, improved narrow codestyle

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ADC: Skip SRB register if not present

the mega8/16/32 don't have ADCSRB, this lead to a crash when we tried to
register a callback on it.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Mega 8/16/32 and PORTA

Still register portA, regardless of PORTA constant initialisation

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Gratuitous realignment

ODC got the better of me

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Converted to use the standard fifo

There's already a standard way to make FIFO's, so converted the
interrupt code to use that.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added support for mega324a / pa..

Support for the renamed SPI block, somehow my headers (debian) don't
have any definition of a second one, but, the macro /should/ support it
now.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #130 from TheCrazyT/twi_i2c_write_fix

Twi i2cwrite fix

fix for wrong return value of i2c_write.

Merge pull request #1 from dougszumski/twi_delay_fix

twi: Remove start condition delay

Merge pull request #126 from ddaygold/typo

Fixed a typo in the manual

Fixed a typo in the manual

Merge pull request #124 from frej/enable-adc-for-atiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

gdb: Cleanup

Also make sure we mask of only 24 bits of the address, newer gdb use one
somehow..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added TIMER2_COMPB to m2560

This was commented out, dunno why..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ihex: Streamlined implementation

Use ihex_read_chunk to implement ihex_read_file, and add a
ihex_free_chuncks for consistency sake

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Add a 'reset pc' that can be nonzero

This allows the AVR to soft reset into the bootloader for example.

A watchdog reset will re-run the bootloader with the correct flag.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

watchdog: Some cleanup

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

hex: Supports offsets larger then 64/128KB

New segemnt type for loading atmega2560 bootloaders

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

simduino: Simplified, made compatible with m2560

Allow testing on atmega256 bootloader too.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Renamed special_* core fields

Added a 'custom' sub struct

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Whitespaces at end of line removed..

Dunno how these came to be..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

elf: Detect start address (for bootloaders)

Allows loading a bootloader ELF as well as .hex with the right starting
PC

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Prevent crash when close() is called twice

flahs() wasn't checking for a valid file pointer

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Redone the logic of delivery

Simplified a few expressions

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Now track pending and running states

Introduced two new IRQs  per vector; one to track pending, and one to
track running state. So you can see any latency issues.
Also introduced a global pending/running IRQ, so you can track issues if
your interrupts overrun etc.

It is reasonably transparent, and seems to have had little impact on the
rest of the code... Hooray for nice clean APIs!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

vcd: Increased limits

Turns out it's easy to reach 32 if you try hard enough!

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

twi: Revert to NO_STATE after a stop

Otherwise the interrupt might get re-triggered

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

adc: Removed spurious trace

Accidentally commited this earlier

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidiot: Further pinout tweaks for 256's

Endless tweaks

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

twi: Always release STOP bit

Seems some libraries assume this bit will autoclear, even if
the stop condition was not really called for.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

adc: bit of reformating

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

shared: Some more tweaks to arduidiot_pins

Added remaining 2560 pins

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Small reformat of long lines

New screen format..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

simavr: Fixed mega250 pinouts for arduidiots

Referenced their headers

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

uart_pty: Added a flush timer

Makes sure the FIFO gets a chance to be cleared after a XOFF

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidiot_pins: Added mega2560

And added a few utilitarian macros.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #121 from guyzmo/improved_osx_support

added support for MacOSX homebrew

added support for MacOSX homebrew

Signed-off-by: Bernard `Guyzmo` Pratz <guyzmo+github@m0g.net>

Merge pull request #120 from frej/avoid-buffer-overrun

Avoid buffer overrun on smaller AVRs

Avoid buffer overrun on smaller AVRs

On smaller AVRs, such as the attiny13, MAX_IOs will be larger than the
size of SRAM which will lead to out of range writes to a malloc
allocated buffer. Therefore limit the number of bytes cleared to the
size of SRAM.

Merge pull request #119 from bsekisser/bsekisser-adc-initfix

adc: check r_adcsrb is valid before init

adc: check r_adcsrb is valid before init

fix issue #118

modified:   simavr/sim/avr_adc.c

Merge pull request #117 from bsekisser/bsekisser-flash-writefix

flash: be sure to use current page for writing

flash: be sure to use current page for writing

bound z to ~(page size - 1), otherwise write may start at anywhere in page to write and fail.

also corrected log line to previous state as was missleading/inacurate.

modified:   simavr/sim/avr_flash.c

lin: Don't reset regs at init time

the reset handler does it

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

lin: Checked a divide by zero condition

As it turn out, static analizer doesn't know lbt is >= 8. Added a
comment there all same for anyon else reading this.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ioport: Don't deref NULL on bad param

that ioctl requires a parameter, but doesn't check it. Static analyzer
doesn't like that at all.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #96 from bsekisser/bsekisser-master-core-remove-bclr-bset

core: Removal of duplicate code...

Merge pull request #110 from cskarai/fix-optiboot-watchdog

Optiboot bootloader unintentionally enables watchdog

Merge pull request #114 from xqms/atmega2560_uart3

Support IO register addresses >= 256

sim_avr.h: increase MAX_IOs by one to 280

ATmega2560 has UDR0 at 0x136 = 310

sim_core + sim_regbit: use 16 bit integers for IO addresses

This is necessary on the larger ATmegas (e.g. ATmega2560).

sim_core: don't hardcode max io register address, use MAX_IOs

add unit test for UART3 echo on ATmega2560

This fails currently because IO addresses >= 256 are not handled correctly
in the core.

Merge pull request #112 from cskarai/fix-timer-ocra-top

Reconfigure fast pwm timer at OCRA write  if OCRA is the top

Merge pull request #111 from cskarai/fix-adc-adate

Implemented: ADC free running mode

Reconfigure fast pwm timer at OCRA write  if OCRA is the top

Fixed: issue with indentation

Added: free_running autotrigger mode

Added: ADC trigger sources

Fixed: optiboot issue, watchdog is unintentionally enabled

Merge pull request #101 from dougszumski/mx_core_add_extint

cores: Adds missing external interrupt for m16/m32

Merge pull request #103 from distributed/dispatch

sim_io: do not overwrite _avr_io_mux_write in avr_register_io_write

do not overwrite _avr_io_mux_write in avr_register_io_write

Merge pull request #98 from bsekisser/bsekisser-watchdog-software-reset

watchdog: reworked to add support for software reset.

watchdog: reworked to add support for software reset.

support for software reset due to watchdog timeout...
based on watchdog documentation.

modified:   sim/sim_avr.c
modifications to avr_reset and avr_init to support software
reset.

modified:   sim/sim_avr.h
added type avr_run_t...
avr_t.run updated accordingly.

modified:   sim/avr_watchdog.c
largely rewritten to support software reset.

modified:   sim/avr_watchdog.h
data record 'reset_context' added to support software reset

modified:   sim/sim_regbit.h
added: avr_regbit_from_value
for checking flags before commiting register value.
added: avr_regbit_set_array_from_value
reverse operation of avr_regbit_get_array