Added sanity check for the .mmcu section handlers

Manage to bite myself on this one.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #194 from hovercraft-github/used_with_simutron

When UART is driven by interrupts, the reception never starts

UART: separate TX/RX pumps, sticky UDRC and RXC interrupt flags.
Fixes #104, #193 and others.

doc: Updated callgraph

Much, much more involved than in used to be. Also shows some functions
problably should be relocated.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

core: Removed UTF8 sequences from comments

Makes the documentation ruby script choke.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #197 from hovercraft-github/eeprom_boundaries

Add EEPROM address boundary checks for read/write operations

Fixes #196 : Add EEPROM address boundary checks for read/write operations

Merge pull request #198 from rlpipkin/master

adc control register write

ensure that the adsrb is written to memory
process avr_adc_configure_trigger after writing the value to memory

Merge pull request #190 from pakesson/uart_fix

Workaround for UART issues when polling in some cases

Workaround for UART issues when polling in some cases

Clear interrupt instead of just the rxc bit

misc: Spacing cleanup

Trailing space removal

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

elf: Fix elf_copy_section

How this ever worked is a wonder

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Add RAMPZ for the 1284p core

That was missing, fixes Issue #186

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

misc: Some more spacing issues

geany catches stray spaces

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #173 from hovercraft-github/timers-ext-clock

Add external clock pin definition and external clocking for timers.

Timers: fixes #177 (interrupt flags reset failure)

Timers: fixes #178, add timer external clock pin definition for megax cores.

Timers: added support for external clock input via a pin (Tn, TOSC1),

a variable frequency for virtual external clock sources including as2 asynchronous clock,
IO control for selecting external clock source and frequency,
external clock pin definition for most cores.

core: Fix rjmp/rcall wrapping around flash boundaries

As per PR #127, spliced

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

regbits: Added attribute unused

As per pull request #127

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

misc: Spacing issues fixed

Trailing spaces removed

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: fix for 1284p timer block

This is the 'approved' way to deal with optional peripherals. Check the
name, or check a register 'address' value for != 0 instead of trying to
use #ifdefs

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #181 from messani/master

Timer fix

casting to uint64_t instead of float

renamed variable cs_div_clock to cs_div_value

Merge pull request #180 from hovercraft-github/sim_gdb_fix

sim_gdb: fix for restore callbacks issue

sim_gdb: fix for restore callbacks issue

Merge pull request #172 from Lotharyx/master

Improve usage message by not listing cores by default

Changed "-list-cores" and "-help" to "--list-cores" and "--help" respectively
Formatted the usage statement to include variants (e.g. -gdb, -g; -trace, -t)

mmcu: add helper macro for sending multi-byte commands

Add helper macro SEND_SIMAVR_CMD() for sending multi-byte commands
in one line. The macro makes use of involved preprocessor trickery to
achieve recursion.

cmds: rewrite command handling and move to separate file

Move AVR command handling code to separate file and add support for
multi-byte, as well as user-defined, commands.

(cherry picked from commit c627c3720a6dcb1f8f7a3068510f11e3fbee0ce4)

Merge pull request #165 from inio/trace_port

Provide IRQs on PORT register when updated via PIN

elf: check for error instead of crashing

Check for error when allocating memory instead of dereferencing a NULL
pointer later in the program.

(cherry picked from commit b3ecaf43cba921c6a257132093107771074ab749)

Conflicts:
simavr/sim/sim_elf.c

elf: Clean up code duplication and fix a cast

Use the helper function elf_copy_section() to get rid of some code
duplication and use the correct printf() type so that there is no cast
necessary.

Conflicts:
simavr/sim/sim_elf.c

elf: Wire up support for Fuses and Lock Bits

Support reading fuses and lock bits from ELF files and loading them into
the simavr internals for later use.

cores: Add a field for Lock Bits and Boot Lock Bits

Add an extra byte for allowing simavr store the chip's lock bits / boot
lock bits as well as set the default value as defined in a number of
specs.

cores: Fix fuse support to handle proper byte size

avr-libc specifies platforms with only 6, 3, 2, 1, and 0 bytes of fuses.
Previously simavr only had 4 bytes available for fuses and assumed any
platform using the CORE_DECLARE macro would have 3 fuses. This change
allows the CORE_DECLARE macro to support any of the platforms supported
by avr-libc with regard to fuses. Additionally add some defines to make
it clear for users of simavr what order the fuses are in.

Merge pull request #176 from hovercraft-github/ext_int_level_triggering

Triggering by level for external interrupts

Merge pull request #161 from obra/patch-1

Small but crucial fix to Homebrew install instructions

Merge pull request #155 from neosilky/fix-memleak

Fix a small memory leak when returning after an error

Implement triggering by level for external interrupts. Fixes bug with Sense Control Bits number detection.

Embettered the usage statement; changed "--list-cores" to "-list-cores" to match "-help"

Removed core list from default usage message; added "--list-cores" command-line flag to list cores

timer: fix calculation of comp_cycles

- bsekisser was right, there must be ocr+1

timer: fixed calculation of divider when using asynchronous 32kHz timer

timer: fixed overflow and output capture interrupts

Provide IRQs on PORT register when updated via PIN

Fixes issue #164

Merge pull request #128 from Zirias/threadsafe-console

make console output thread-safe (q&d)

make console output thread-safe

Merge pull request #154 from squell/master

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 110…

Small but crucial fix to Homebrew install instructions

Merge pull request #158 from dougszumski/feature/ds1338_real_time_clock_part

Feature/ds1338 real time clock part

examples: TWI driver used by the DS1338 RTC demo

examples: take the DS1338 virtual real time clock for a test drive

This demo consists of a DS1338 RTC connected via the TWI bus of an
atmega32. The square wave output of the DS1338 is enabled, with the
tick-rate set to 1HZ. This is then fed to pin D3 on the atmega32
which is configured to generate an interrupt on a rising edge. When
the interrupt fires the time is read from the DS1338.

parts: DS1338 real time clock which runs on the TWI bus

Features:

> External oscillator synced to the AVR core
> Square wave output with scalable frequency
> Leap year correction until 2100 (just like the real thing!)

Should also work for the pin compatible DS1307 device, but that part
hasn't been tested against actual hardware.

Fix a small memory leak when returning after an error

added ELPM instruction with implied r0 register (opcode 1001 0101 1101 1000)

Merge pull request #148 from jedahan/install-instructions

Add install instructions

Merge pull request #149 from jedahan/homebrew-prefix

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Merge pull request #152 from stevedrake/macports-support

Update support for building with MacPorts

Merge pull request #153 from stevedrake/fix-sleep-1s

Support sleep interval of 1s or greater in gdb

build: updated support for building with MacPorts

Updated Macports support based on Homebrew support.  Set correct paths
for MacPorts-provided avr-gcc and libelf.

gdb: support sleep interval of 1s or greater

Split sleep interval into seconds and microseconds to create a valid
timeval to pass as the timeout to select().

Removed comment, which refers to old code that used a fixed interval.

Allow for homebrew installed avr-gcc to any prefix

Add install instructions

Merge pull request #145 from xqms/interrupt_fifo_fix

sim_interrupts: fix FIFO move operation

sim_interrupts: fix FIFO move operation

The variable 'mini' is a FIFO index, not a direct index into the buffer!
Add the current read pointer to fix the operation.

Fixes a regression introduced in 599733f261f94317489c2cc8751fb84fd604e6fa.

Merge pull request #141 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16-fixup

core: fixup missing dependancy from r16 commit

core: fixup missing dependancy from r16 commit

several commits were pushed to a branch which I later split...
one commit had a dependency I missed which this fixes.

modified:   sim/sim_core.c
fix missing dependance in MOVW instruction.

Merge pull request #135 from bsekisser/bsekisser-master-timer-clear-cancel-changes

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

Merge pull request #134 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-r16

core: add pair of 16 bit set register functions

timer: rework timer clear commit.

reworked to use single function with const flag to clear.
set to inline, depends on dce.

modified:   sim/avr_timer.c

Merge pull request #133 from bsekisser/bsekisser-master-core-access-flash16

core: change 16 bit flash access

avr_timer: add avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers

modified:   sim/avr_timer.c
added: avr_timer_clear_and_cancel_all_cycle_timers
fixes a few oversights in original commit(s)

core: add pair of 16 bit set register functions

added: _avr_set_r16le and _avr_set_r16le_hl
_avr_set_r16le_hl preserves reverse register set order where used
two register set calls become a single call.

core: change 16 bit flash access

modified:   sim/sim_core.c
added _avr_flash_read16le accessor function
changed "avr->flash[addr] | (avr->flash[addr + 1] << 8)"
to "_avr_flash_read16le(avr, addr)"

ioport: Don't crash if core defition is incomplete

This is not something that happends on existing cores, but can be
annoying when defining a new one.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

io: No functional changes

Just reformating

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timer: Added a selective trace option

Allows tracing one timer only

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

arduidio: Simplified pin mapping

Again...

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

timers: Gratuitous realignment

Go on with the new, improved narrow codestyle

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ADC: Skip SRB register if not present

the mega8/16/32 don't have ADCSRB, this lead to a crash when we tried to
register a callback on it.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Mega 8/16/32 and PORTA

Still register portA, regardless of PORTA constant initialisation

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Gratuitous realignment

ODC got the better of me

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

interrupts: Converted to use the standard fifo

There's already a standard way to make FIFO's, so converted the
interrupt code to use that.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added support for mega324a / pa..

Support for the renamed SPI block, somehow my headers (debian) don't
have any definition of a second one, but, the macro /should/ support it
now.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

Merge pull request #130 from TheCrazyT/twi_i2c_write_fix

Twi i2cwrite fix

fix for wrong return value of i2c_write.

Merge pull request #1 from dougszumski/twi_delay_fix

twi: Remove start condition delay

Merge pull request #126 from ddaygold/typo

Fixed a typo in the manual

Fixed a typo in the manual

Merge pull request #124 from frej/enable-adc-for-atiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

cores: Add ADC to the ATtiny13

gdb: Cleanup

Also make sure we mask of only 24 bits of the address, newer gdb use one
somehow..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

cores: Added TIMER2_COMPB to m2560

This was commented out, dunno why..

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

ihex: Streamlined implementation

Use ihex_read_chunk to implement ihex_read_file, and add a
ihex_free_chuncks for consistency sake

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

avr: Add a 'reset pc' that can be nonzero

This allows the AVR to soft reset into the bootloader for example.

A watchdog reset will re-run the bootloader with the correct flag.

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

watchdog: Some cleanup

No functional changes

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>

hex: Supports offsets larger then 64/128KB

New segemnt type for loading atmega2560 bootloaders

Signed-off-by: Michel Pollet <buserror@gmail.com>